ブルース・バナー博士（エドワード・ノートン）は緑色の巨人ハルクに変身する能力を隠して生活する日々を送っていたが、ハルクの変身の秘密を知ったテロリスト（ティム・ロス）が怪人アボミネーションと化し、ニューヨークの街を襲う。恋人ベティ（リヴ・タイラー）と街を守るため、ブルースはハルクに変身して危機に立ち向かう。